Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn34c1Q8K193 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms