Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrit1Q8K099 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrit1Q8K099 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrit1Q8K099 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrit1Q8K099 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrit1Q8K099 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrit1Q8K099 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrit1Q8K099 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrit1Q8K099 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
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Lrit1Q8K099 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrit1Q8K099 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
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Lrit1Q8K099 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrit1Q8K099 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrit1Q8K099 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrit1Q8K099 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrit1Q8K099 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrit1Q8K099 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
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Lrit1Q8K099 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
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Lrit1Q8K099 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrit1Q8K099 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrit1Q8K099 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrit1Q8K099 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrit1Q8K099 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrit1Q8K099 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrit1Q8K099 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrit1Q8K099 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrit1Q8K099 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrit1Q8K099 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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Lrit1Q8K099 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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Lrit1Q8K099 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrit1Q8K099 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrit1Q8K099 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrit1Q8K099 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrit1Q8K099 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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Lrit1Q8K099 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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Lrit1Q8K099 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrit1Q8K099 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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Lrit1Q8K099 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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Lrit1Q8K099 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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Lrit1Q8K099 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrit1Q8K099 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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Lrit1Q8K099 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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Lrit1Q8K099 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrit1Q8K099 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrit1Q8K099 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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Lrit1Q8K099 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrit1Q8K099 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrit1Q8K099 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrit1Q8K099 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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Lrit1Q8K099 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrit1Q8K099 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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Lrit1Q8K099 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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Lrit1Q8K099 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrit1Q8K099 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms