Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip10Q8CJ53 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms