Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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SbsnQ8CIT9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SbsnQ8CIT9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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SbsnQ8CIT9 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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SbsnQ8CIT9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SbsnQ8CIT9 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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SbsnQ8CIT9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SbsnQ8CIT9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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SbsnQ8CIT9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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SbsnQ8CIT9 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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SbsnQ8CIT9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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SbsnQ8CIT9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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SbsnQ8CIT9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SbsnQ8CIT9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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SbsnQ8CIT9 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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SbsnQ8CIT9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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SbsnQ8CIT9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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