Protein–RNA interactions for Protein: Q8CII8

Syne4, Nesprin-4, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne4Q8CII8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syne4Q8CII8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms