Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF7

Tcerg1, Transcription elongation regulator 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcerg1Q8CGF7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcerg1Q8CGF7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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