Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE20

9030612E09Rik, RIKEN cDNA 9030612E09, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9030612E09RikQ8CE20 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
9030612E09RikQ8CE20 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
9030612E09RikQ8CE20 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
9030612E09RikQ8CE20 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms