Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDT7

Cabcoco1, Ciliary-associated calcium-binding coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabcoco1Q8CDT7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Cabcoco1Q8CDT7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Cabcoco1Q8CDT7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms