Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM1

Atad2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2Q8CDM1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms