Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDE2

Ccin, Calicin, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcinQ8CDE2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CcinQ8CDE2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CcinQ8CDE2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CcinQ8CDE2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CcinQ8CDE2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CcinQ8CDE2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CcinQ8CDE2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CcinQ8CDE2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CcinQ8CDE2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CcinQ8CDE2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CcinQ8CDE2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CcinQ8CDE2 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CcinQ8CDE2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CcinQ8CDE2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CcinQ8CDE2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CcinQ8CDE2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CcinQ8CDE2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CcinQ8CDE2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CcinQ8CDE2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcinQ8CDE2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms