Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD19

Lancl3, LanC-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl3Q8CD19 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lancl3Q8CD19 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms