Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC96

Uncharacterized protein C6orf222 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CC96 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8CC96 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8CC96 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8CC96 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8CC96 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8CC96 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8CC96 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8CC96 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8CC96 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8CC96 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8CC96 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8CC96 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8CC96 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8CC96 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8CC96 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8CC96 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8CC96 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8CC96 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8CC96 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8CC96 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8CC96 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8CC96 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8CC96 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8CC96 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8CC96 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8CC96 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8CC96 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8CC96 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8CC96 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8CC96 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8CC96 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8CC96 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8CC96 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8CC96 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8CC96 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8CC96 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8CC96 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8CC96 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8CC96 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8CC96 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8CC96 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8CC96 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8CC96 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8CC96 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8CC96 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8CC96 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8CC96 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8CC96 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8CC96 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8CC96 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8CC96 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8CC96 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8CC96 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8CC96 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8CC96 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8CC96 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8CC96 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8CC96 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8CC96 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8CC96 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8CC96 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8CC96 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8CC96 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8CC96 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8CC96 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8CC96 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8CC96 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8CC96 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8CC96 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8CC96 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8CC96 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8CC96 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8CC96 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8CC96 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8CC96 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8CC96 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8CC96 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8CC96 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8CC96 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8CC96 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8CC96 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8CC96 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8CC96 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8CC96 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8CC96 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8CC96 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8CC96 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8CC96 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8CC96 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8CC96 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8CC96 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8CC96 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8CC96 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8CC96 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8CC96 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8CC96 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8CC96 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8CC96 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8CC96 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8CC96 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms