Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBY1

Samd4a, Protein Smaug homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd4aQ8CBY1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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