Protein–RNA interactions for Protein: Q8C963

Ccdc159, Coiled-coil domain-containing protein 159, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc159Q8C963 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc159Q8C963 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc159Q8C963 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms