Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms