Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Q8C5C9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q8C5C9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q8C5C9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q8C5C9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q8C5C9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q8C5C9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms