Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc90bQ8C3X2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc90bQ8C3X2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc90bQ8C3X2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc90bQ8C3X2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc90bQ8C3X2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc90bQ8C3X2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc90bQ8C3X2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc90bQ8C3X2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc90bQ8C3X2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc90bQ8C3X2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc90bQ8C3X2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc90bQ8C3X2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc90bQ8C3X2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc90bQ8C3X2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc90bQ8C3X2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc90bQ8C3X2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc90bQ8C3X2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc90bQ8C3X2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc90bQ8C3X2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc90bQ8C3X2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc90bQ8C3X2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc90bQ8C3X2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc90bQ8C3X2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc90bQ8C3X2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc90bQ8C3X2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc90bQ8C3X2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc90bQ8C3X2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc90bQ8C3X2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc90bQ8C3X2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc90bQ8C3X2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc90bQ8C3X2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc90bQ8C3X2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc90bQ8C3X2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc90bQ8C3X2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc90bQ8C3X2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc90bQ8C3X2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc90bQ8C3X2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc90bQ8C3X2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc90bQ8C3X2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc90bQ8C3X2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc90bQ8C3X2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc90bQ8C3X2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc90bQ8C3X2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc90bQ8C3X2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc90bQ8C3X2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc90bQ8C3X2 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc90bQ8C3X2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc90bQ8C3X2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc90bQ8C3X2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc90bQ8C3X2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc90bQ8C3X2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc90bQ8C3X2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc90bQ8C3X2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc90bQ8C3X2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc90bQ8C3X2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc90bQ8C3X2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc90bQ8C3X2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc90bQ8C3X2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc90bQ8C3X2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc90bQ8C3X2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc90bQ8C3X2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc90bQ8C3X2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc90bQ8C3X2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc90bQ8C3X2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc90bQ8C3X2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc90bQ8C3X2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc90bQ8C3X2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc90bQ8C3X2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc90bQ8C3X2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc90bQ8C3X2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc90bQ8C3X2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc90bQ8C3X2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc90bQ8C3X2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc90bQ8C3X2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc90bQ8C3X2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc90bQ8C3X2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc90bQ8C3X2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc90bQ8C3X2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc90bQ8C3X2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc90bQ8C3X2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc90bQ8C3X2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc90bQ8C3X2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc90bQ8C3X2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc90bQ8C3X2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc90bQ8C3X2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc90bQ8C3X2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc90bQ8C3X2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc90bQ8C3X2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc90bQ8C3X2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc90bQ8C3X2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc90bQ8C3X2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc90bQ8C3X2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc90bQ8C3X2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc90bQ8C3X2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc90bQ8C3X2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc90bQ8C3X2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc90bQ8C3X2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms