Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo3Q8C2S7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Amigo3Q8C2S7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Amigo3Q8C2S7 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Amigo3Q8C2S7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Amigo3Q8C2S7 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Amigo3Q8C2S7 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Amigo3Q8C2S7 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Amigo3Q8C2S7 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Amigo3Q8C2S7 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Amigo3Q8C2S7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Amigo3Q8C2S7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Amigo3Q8C2S7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Amigo3Q8C2S7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Amigo3Q8C2S7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Amigo3Q8C2S7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Amigo3Q8C2S7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Amigo3Q8C2S7 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Amigo3Q8C2S7 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms