Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms