Protein–RNA interactions for Protein: Q8C050

Rps6ka5, Ribosomal protein S6 kinase alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka5Q8C050 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps6ka5Q8C050 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps6ka5Q8C050 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms