Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV66

Ifi44, Interferon-induced protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi44Q8BV66 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifi44Q8BV66 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifi44Q8BV66 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifi44Q8BV66 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifi44Q8BV66 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifi44Q8BV66 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifi44Q8BV66 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifi44Q8BV66 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifi44Q8BV66 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifi44Q8BV66 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifi44Q8BV66 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifi44Q8BV66 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifi44Q8BV66 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifi44Q8BV66 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifi44Q8BV66 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifi44Q8BV66 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifi44Q8BV66 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifi44Q8BV66 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifi44Q8BV66 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifi44Q8BV66 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifi44Q8BV66 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifi44Q8BV66 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifi44Q8BV66 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifi44Q8BV66 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifi44Q8BV66 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifi44Q8BV66 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifi44Q8BV66 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifi44Q8BV66 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifi44Q8BV66 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifi44Q8BV66 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifi44Q8BV66 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifi44Q8BV66 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifi44Q8BV66 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifi44Q8BV66 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifi44Q8BV66 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifi44Q8BV66 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifi44Q8BV66 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifi44Q8BV66 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifi44Q8BV66 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifi44Q8BV66 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifi44Q8BV66 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifi44Q8BV66 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifi44Q8BV66 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifi44Q8BV66 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifi44Q8BV66 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifi44Q8BV66 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifi44Q8BV66 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifi44Q8BV66 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifi44Q8BV66 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifi44Q8BV66 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifi44Q8BV66 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifi44Q8BV66 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifi44Q8BV66 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifi44Q8BV66 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifi44Q8BV66 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifi44Q8BV66 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifi44Q8BV66 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifi44Q8BV66 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifi44Q8BV66 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifi44Q8BV66 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifi44Q8BV66 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifi44Q8BV66 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifi44Q8BV66 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifi44Q8BV66 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifi44Q8BV66 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifi44Q8BV66 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifi44Q8BV66 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifi44Q8BV66 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifi44Q8BV66 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifi44Q8BV66 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifi44Q8BV66 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifi44Q8BV66 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifi44Q8BV66 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifi44Q8BV66 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifi44Q8BV66 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifi44Q8BV66 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifi44Q8BV66 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifi44Q8BV66 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifi44Q8BV66 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifi44Q8BV66 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifi44Q8BV66 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifi44Q8BV66 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifi44Q8BV66 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifi44Q8BV66 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifi44Q8BV66 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifi44Q8BV66 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifi44Q8BV66 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifi44Q8BV66 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifi44Q8BV66 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifi44Q8BV66 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifi44Q8BV66 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifi44Q8BV66 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifi44Q8BV66 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifi44Q8BV66 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifi44Q8BV66 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifi44Q8BV66 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifi44Q8BV66 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifi44Q8BV66 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifi44Q8BV66 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifi44Q8BV66 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms