Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS3

Gbp9, Guanylate-binding protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp9Q8BTS3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp9Q8BTS3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms