Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL74

Gtf3c2, General transcription factor 3C polypeptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c2Q8BL74 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf3c2Q8BL74 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms