Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms