Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Smarcal1Q8BJL0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcal1Q8BJL0 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcal1Q8BJL0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcal1Q8BJL0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcal1Q8BJL0 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcal1Q8BJL0 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcal1Q8BJL0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcal1Q8BJL0 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcal1Q8BJL0 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcal1Q8BJL0 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcal1Q8BJL0 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcal1Q8BJL0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcal1Q8BJL0 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcal1Q8BJL0 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcal1Q8BJL0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcal1Q8BJL0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcal1Q8BJL0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcal1Q8BJL0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcal1Q8BJL0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcal1Q8BJL0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcal1Q8BJL0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcal1Q8BJL0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smarcal1Q8BJL0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smarcal1Q8BJL0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Smarcal1Q8BJL0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Smarcal1Q8BJL0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smarcal1Q8BJL0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smarcal1Q8BJL0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smarcal1Q8BJL0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smarcal1Q8BJL0 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smarcal1Q8BJL0 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smarcal1Q8BJL0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smarcal1Q8BJL0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smarcal1Q8BJL0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smarcal1Q8BJL0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smarcal1Q8BJL0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smarcal1Q8BJL0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smarcal1Q8BJL0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smarcal1Q8BJL0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smarcal1Q8BJL0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smarcal1Q8BJL0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smarcal1Q8BJL0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smarcal1Q8BJL0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smarcal1Q8BJL0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smarcal1Q8BJL0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smarcal1Q8BJL0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smarcal1Q8BJL0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smarcal1Q8BJL0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smarcal1Q8BJL0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms