Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ73

Rspo4, R-spondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo4Q8BJ73 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo4Q8BJ73 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms