Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHH8

Clrn3, Clarin-3, mousemouse

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Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3Q8BHH8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Clrn3Q8BHH8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clrn3Q8BHH8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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