Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGX2

Timm29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm29Q8BGX2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Timm29Q8BGX2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timm29Q8BGX2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timm29Q8BGX2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timm29Q8BGX2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timm29Q8BGX2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timm29Q8BGX2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timm29Q8BGX2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timm29Q8BGX2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timm29Q8BGX2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timm29Q8BGX2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timm29Q8BGX2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timm29Q8BGX2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timm29Q8BGX2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timm29Q8BGX2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timm29Q8BGX2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timm29Q8BGX2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timm29Q8BGX2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timm29Q8BGX2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timm29Q8BGX2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timm29Q8BGX2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timm29Q8BGX2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timm29Q8BGX2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timm29Q8BGX2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timm29Q8BGX2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Timm29Q8BGX2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timm29Q8BGX2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms