Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGT7

Smndc1, Survival of motor neuron-related-splicing factor 30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smndc1Q8BGT7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Smndc1Q8BGT7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smndc1Q8BGT7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smndc1Q8BGT7 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smndc1Q8BGT7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smndc1Q8BGT7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smndc1Q8BGT7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smndc1Q8BGT7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smndc1Q8BGT7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smndc1Q8BGT7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smndc1Q8BGT7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smndc1Q8BGT7 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smndc1Q8BGT7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms