Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8BGC1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8BGC1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8BGC1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8BGC1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8BGC1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms