Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFS6

Cpped1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpped1Q8BFS6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cpped1Q8BFS6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms