Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW9

H2-M10.2, Histocompatibility 2, M region locus 10.2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.2Q85ZW9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.2Q85ZW9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms