Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms