Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms