Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Liat1Q810M6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Liat1Q810M6 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms