Protein–RNA interactions for Protein: Q810I2

Trim50, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM50, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim50Q810I2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim50Q810I2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim50Q810I2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim50Q810I2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim50Q810I2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim50Q810I2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim50Q810I2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim50Q810I2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim50Q810I2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim50Q810I2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim50Q810I2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim50Q810I2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim50Q810I2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim50Q810I2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim50Q810I2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim50Q810I2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim50Q810I2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim50Q810I2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim50Q810I2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim50Q810I2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim50Q810I2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim50Q810I2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim50Q810I2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim50Q810I2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim50Q810I2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim50Q810I2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim50Q810I2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim50Q810I2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms