Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn34b3Q80ZS5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn34b3Q80ZS5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn34b3Q80ZS5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn34b3Q80ZS5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn34b3Q80ZS5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34b3Q80ZS5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34b3Q80ZS5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34b3Q80ZS5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34b3Q80ZS5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34b3Q80ZS5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34b3Q80ZS5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34b3Q80ZS5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34b3Q80ZS5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34b3Q80ZS5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34b3Q80ZS5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34b3Q80ZS5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34b3Q80ZS5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34b3Q80ZS5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34b3Q80ZS5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34b3Q80ZS5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34b3Q80ZS5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34b3Q80ZS5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34b3Q80ZS5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34b3Q80ZS5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34b3Q80ZS5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34b3Q80ZS5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34b3Q80ZS5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Cldn34b3Q80ZS5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34b3Q80ZS5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34b3Q80ZS5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34b3Q80ZS5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34b3Q80ZS5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34b3Q80ZS5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34b3Q80ZS5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34b3Q80ZS5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34b3Q80ZS5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34b3Q80ZS5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34b3Q80ZS5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn34b3Q80ZS5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn34b3Q80ZS5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn34b3Q80ZS5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn34b3Q80ZS5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn34b3Q80ZS5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn34b3Q80ZS5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn34b3Q80ZS5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn34b3Q80ZS5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn34b3Q80ZS5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn34b3Q80ZS5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn34b3Q80ZS5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn34b3Q80ZS5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn34b3Q80ZS5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn34b3Q80ZS5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Cldn34b3Q80ZS5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn34b3Q80ZS5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn34b3Q80ZS5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn34b3Q80ZS5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn34b3Q80ZS5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Cldn34b3Q80ZS5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Cldn34b3Q80ZS5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Cldn34b3Q80ZS5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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