Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms