Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Npm2Q80W85 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Npm2Q80W85 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Npm2Q80W85 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Npm2Q80W85 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Npm2Q80W85 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Npm2Q80W85 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Npm2Q80W85 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Npm2Q80W85 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Npm2Q80W85 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Npm2Q80W85 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Npm2Q80W85 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Npm2Q80W85 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Npm2Q80W85 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Npm2Q80W85 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Npm2Q80W85 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Npm2Q80W85 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Npm2Q80W85 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Npm2Q80W85 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Npm2Q80W85 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Npm2Q80W85 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Npm2Q80W85 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Npm2Q80W85 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Npm2Q80W85 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Npm2Q80W85 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Npm2Q80W85 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Npm2Q80W85 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Npm2Q80W85 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Npm2Q80W85 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Npm2Q80W85 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Npm2Q80W85 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms