Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Lrrc1Q80VQ1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Lrrc1Q80VQ1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Lrrc1Q80VQ1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Lrrc1Q80VQ1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Lrrc1Q80VQ1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Lrrc1Q80VQ1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc1Q80VQ1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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