Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms