Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lamp3Q7TST5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lamp3Q7TST5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms