Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms