Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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Clec18aQ7TSQ1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec18aQ7TSQ1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec18aQ7TSQ1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Clec18aQ7TSQ1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Clec18aQ7TSQ1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec18aQ7TSQ1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec18aQ7TSQ1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Clec18aQ7TSQ1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Clec18aQ7TSQ1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms