Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSK3

Pcdh8, Protocadherin-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh8Q7TSK3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcdh8Q7TSK3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms