Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPV4

Mybbp1a, Myb-binding protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mybbp1aQ7TPV4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mybbp1aQ7TPV4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mybbp1aQ7TPV4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mybbp1aQ7TPV4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mybbp1aQ7TPV4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mybbp1aQ7TPV4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mybbp1aQ7TPV4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mybbp1aQ7TPV4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mybbp1aQ7TPV4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mybbp1aQ7TPV4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mybbp1aQ7TPV4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mybbp1aQ7TPV4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mybbp1aQ7TPV4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Mybbp1aQ7TPV4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mybbp1aQ7TPV4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mybbp1aQ7TPV4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Mybbp1aQ7TPV4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mybbp1aQ7TPV4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mybbp1aQ7TPV4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mybbp1aQ7TPV4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mybbp1aQ7TPV4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mybbp1aQ7TPV4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mybbp1aQ7TPV4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mybbp1aQ7TPV4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mybbp1aQ7TPV4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mybbp1aQ7TPV4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mybbp1aQ7TPV4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mybbp1aQ7TPV4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mybbp1aQ7TPV4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mybbp1aQ7TPV4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Mybbp1aQ7TPV4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Mybbp1aQ7TPV4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Mybbp1aQ7TPV4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mybbp1aQ7TPV4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms