Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMK9

Syncrip, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncripQ7TMK9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms