Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn4bQ7M729 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn4bQ7M729 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn4bQ7M729 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn4bQ7M729 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn4bQ7M729 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn4bQ7M729 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn4bQ7M729 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn4bQ7M729 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn4bQ7M729 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn4bQ7M729 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn4bQ7M729 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn4bQ7M729 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn4bQ7M729 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn4bQ7M729 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Scn4bQ7M729 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn4bQ7M729 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn4bQ7M729 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn4bQ7M729 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn4bQ7M729 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn4bQ7M729 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn4bQ7M729 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn4bQ7M729 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn4bQ7M729 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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Scn4bQ7M729 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn4bQ7M729 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Scn4bQ7M729 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn4bQ7M729 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn4bQ7M729 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn4bQ7M729 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Scn4bQ7M729 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn4bQ7M729 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Scn4bQ7M729 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn4bQ7M729 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn4bQ7M729 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn4bQ7M729 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn4bQ7M729 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn4bQ7M729 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Scn4bQ7M729 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Scn4bQ7M729 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn4bQ7M729 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn4bQ7M729 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn4bQ7M729 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Scn4bQ7M729 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn4bQ7M729 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn4bQ7M729 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn4bQ7M729 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn4bQ7M729 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn4bQ7M729 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn4bQ7M729 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn4bQ7M729 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn4bQ7M729 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn4bQ7M729 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn4bQ7M729 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn4bQ7M729 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn4bQ7M729 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn4bQ7M729 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn4bQ7M729 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn4bQ7M729 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn4bQ7M729 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn4bQ7M729 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn4bQ7M729 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn4bQ7M729 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn4bQ7M729 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn4bQ7M729 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn4bQ7M729 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn4bQ7M729 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn4bQ7M729 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn4bQ7M729 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn4bQ7M729 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn4bQ7M729 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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