Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Trappc6aQ78XR0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Trappc6aQ78XR0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Trappc6aQ78XR0 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Trappc6aQ78XR0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trappc6aQ78XR0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trappc6aQ78XR0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trappc6aQ78XR0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc6aQ78XR0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc6aQ78XR0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc6aQ78XR0 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc6aQ78XR0 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc6aQ78XR0 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc6aQ78XR0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc6aQ78XR0 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc6aQ78XR0 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc6aQ78XR0 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc6aQ78XR0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc6aQ78XR0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc6aQ78XR0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc6aQ78XR0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc6aQ78XR0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc6aQ78XR0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc6aQ78XR0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc6aQ78XR0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc6aQ78XR0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc6aQ78XR0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc6aQ78XR0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc6aQ78XR0 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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