Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nme8Q715T0 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms